檢察機(jī)關(guān)刑事立案的程序是：

1、由承辦案件的人員制作《立案請示報(bào)告》；

2、經(jīng)部門負(fù)責(zé)人或者主辦檢察官審查；再次，由部門負(fù)責(zé)組織討論同意；

3、由部門負(fù)責(zé)人或主辦檢察官報(bào)請檢察長批準(zhǔn)。重大、復(fù)雜或者疑難的案件，還要由檢察長提請檢察委員會討論決定。經(jīng)過批準(zhǔn)或決定以后，由承辦人填寫《立案決定書》，人民檢察院據(jù)此正式對案件展開偵查。《立案決定書》要載明犯罪嫌疑人的姓名、涉嫌的罪名、立案的法律依據(jù)、立案的機(jī)關(guān)、立案的時間等內(nèi)容，立案決定書上要有檢察長簽字印章。

為了加強(qiáng)對檢察權(quán)的監(jiān)督制約，最高人民檢察院檢察委員會第十屆第三十九次會議于２００５年９月２３日通過了《人民檢察院直接受理偵查案件立案、逮捕實(shí)行備案審查的規(guī)定（試行）》和《關(guān)于省級以下人民檢察院對直接受理偵查案件作撤銷案件、不起訴決定報(bào)上一級人民檢察院批準(zhǔn)的規(guī)定（試行）》。規(guī)定省級以下（含省級）人民檢察院辦理直接受理偵查案件，決定立案、逮捕的，應(yīng)當(dāng)報(bào)上一級人民檢察院備案審查；省級以下（含省級）人民檢察院辦理直接受理偵查的案件，擬作撤銷案件、不起訴決定的，在履行了人民監(jiān)督員監(jiān)督程序后，報(bào)請上一級人民檢察院批準(zhǔn)。

為了貫徹落實(shí)《中華人民共和國全國人民代表大會和地方各級人民代表大會代表法》對人民代表大會代表執(zhí)行職務(wù)司法保障的規(guī)定，最高人民檢察院對依法決定對人民代表立案的程序作了特殊規(guī)定：１．對擔(dān)任本級人大代表的犯罪嫌疑人立案，直接向本級人大主席團(tuán)或常委會通報(bào)情況。２．對擔(dān)任上級人大代表的犯罪嫌疑人立案，向該代表所屬的人大同級的檢察院通報(bào)情況。３．對擔(dān)任下級人大代表的犯罪嫌疑人立案，可以直接向該代表所屬的人大主席團(tuán)或常委會通報(bào)情況，也可以委托該代表所屬的人大同級的檢察院通報(bào)情況；對擔(dān)任鄉(xiāng)、民族鄉(xiāng)、鎮(zhèn)的人大代表的犯罪嫌疑人立案，由縣級檢察院報(bào)告鄉(xiāng)、民族鄉(xiāng)、鎮(zhèn)的人民代表大會。對擔(dān)任兩級以上人大代表的犯罪嫌疑人立案，分別按照上述方式通報(bào)情況。４．對擔(dān)任辦案單位所在省、市、縣（區(qū)）以外的其他地區(qū)人大代表的犯罪嫌疑人立案，應(yīng)當(dāng)委托該代表所屬的人大同級的檢察院通報(bào)情況。擔(dān)任兩級以上人大代表的，應(yīng)當(dāng)分別委托該代表所屬的人大同級的檢察院通報(bào)情況。

刑事案立案規(guī)定：

人民法院、人民檢察院或者公安機(jī)關(guān)對于報(bào)案、控告、舉報(bào)和自首的材料，應(yīng)當(dāng)按照管轄范圍，迅速進(jìn)行審查，認(rèn)為有犯罪事實(shí)需要追究刑事責(zé)任的時候，應(yīng)當(dāng)立案；認(rèn)為沒有犯罪事實(shí)，或者犯罪事實(shí)顯著輕微，不需要追究刑事責(zé)任的時候，不予立案，并且將不立案的原因通知控告人。控告人如果不服，可以申請復(fù)議。