第二種意見認為，應當區(qū)分土地征收、征用補償費用的性質(zhì)，其中，由村委會協(xié)助人民政府管理、發(fā)放給村民的部分，屬于公共財物，非法占為己有構(gòu)成貪污；本應歸屬村委會集體所有的部分，屬于村集體財物，非法占為己有構(gòu)成職務侵占。

理由如下：土地征收、征用補償費用的管理，情況比較復雜，主要指國家征用土地后，對所發(fā)放的土地補償費、地上附著物和青苗補償費的管理。《中華人民共和國土地管理法實施條例》規(guī)定，地上附著物及青苗補償費歸地上附著物及青苗的所有者所有。基層組織協(xié)助人民政府將這部分款項發(fā)放給土地承包人，顯然屬于從事公務。但是，土地補償費是村集體財產(chǎn)還是公款，對該款的管理、發(fā)放是村內(nèi)自治事務還是從事公務，存在一定爭議，實踐中需根據(jù)不同情況判斷。

首先，代政府發(fā)放給土地承包人的情況。國土資源部《關于完善征地補償安置制度的指導意見》規(guī)定，“按照土地補償費主要用于被征地農(nóng)戶的原則，土地補償費應在農(nóng)村集體經(jīng)濟組織內(nèi)部合理分配。具體分配辦法由省級人民政府制定”。此后，不少省級人民政府以地方政府規(guī)章等形式明文規(guī)定，應將70%至90%的農(nóng)用地土地補償費支付給被征地農(nóng)民，剩余部分歸村集體使用。據(jù)此，村基層組織依照人民政府的規(guī)定，將土地補償費發(fā)放給被征地農(nóng)民的，應當認定為從事公務。

需要注意的是，在此情況下，即使相關補償費被撥入村委會賬戶，也仍屬村委會代為管理的公款，村委會人員協(xié)助政府進行管理的職責并未結(jié)束，其進行的發(fā)放工作仍屬協(xié)助政府從事公務，在此過程中將公款非法占有的，應當認定為貪污。

其次，應歸屬村集體的情況。其中，一是土地補償費留給村集體使用的部分。這部分費用，經(jīng)村民大會討論表決，并由村集體予以提留，即成為村集體財產(chǎn)。例如，按照有關規(guī)定，土地補償費按80%給被征地農(nóng)戶的標準扣除后，村集體提留的剩余20%，即為村集體財產(chǎn)。村基層組織人員侵吞村集體所有的資金，應以職務侵占性質(zhì)認定。二是農(nóng)用地以外的其他土地的補償費用。農(nóng)村集體土地情況比較復雜，可分為農(nóng)用地、建設用地、公用地、未利用地等。征用公用地、生產(chǎn)路、村上便道、未利用地等土地后發(fā)放給村集體的土地補償費，屬于村集體財產(chǎn)，行為人非法占有這部分錢款，也應以職務侵占性質(zhì)認定。

在所舉案例中，南水北調(diào)工程永久用地補償費系因村集體土地被國家征用而支付的補償費用，但對具體是何種集體土地，案例中交代不十分清晰。如果這些土地是已被農(nóng)民家庭承包的農(nóng)用地，村基層組織代為管理補償費和發(fā)放給農(nóng)戶，則應當認定為公款，村基層組織人員管理、發(fā)放行為屬于從事公務，將公款非法占有則構(gòu)成貪污。但是，如果這些土地是村集體用地抑或其他未利用地，則這些款項本應屬于村集體所有，性質(zhì)上不是公款，將這些款項非法占有，應構(gòu)成職務侵占。

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